Die Monster stritten erneut und erklärten sich sogar gegenseitig den Krieg, und das sollte nicht überraschen. Schließlich hatten sie nie gegenseitiges Verständnis. Sie werden eine der Seiten einnehmen, um ihr zum Sieg zu verhelfen. Dazu müssen Sie eine Strategie und Taktik entwickeln, denn in Merge Monster: Rainbow Master sind die Kräfte die gleichen.